根据损伤影响到肝内胆管还是肝外胆管，胆汁淤积性肝病可以分为两大类，肝内胆管淤积或肝外胆管淤积。区分二者最简单的诊断试验是肝脏超声。肝脏超声可以很好的鉴别出肝外胆管淤积。因此，胆汁淤积性肝损伤的鉴别诊断应该从肝脏超声开始，用以鉴别肝内胆管淤积和肝外胆管淤积。
ALP升高的诊断流程
胆汁郁积性肝病的原因病*性肝炎
病*性肝炎是最常见的导致肝细胞损伤（即AST和ALT升高占主导地位）的肝脏疾病原因。然在，病*性肝炎在极少数情况下导致胆汁淤积性肝损伤。
自身免疫性肝病
自身免疫性肝病的三种最常见的形式为自身免疫性肝炎、原发性胆汁性胆管炎（PBC）和原发性硬化性胆管炎（PSC）。
自身免疫性肝炎的特点是血清ALT和AST水平较高，而原发性胆汁性胆管炎和原发性硬化性胆管炎为胆汁淤积性疾病，因此与碱性磷酸酶（ALP）的显著升高相关。如果患者的碱性磷酸酶水平远高于其ALT和AST水平，则其更有可能发生了后两种疾病。
原发性胆汁性胆管炎（和自身免疫性肝炎）与血清中的自身抗体相关，如抗核抗体，平滑肌抗体和抗线粒体抗体。
原发性硬化性胆管炎通常影响肝外胆道系统。此外，原发性硬化性胆管炎与炎症性肠病，尤其是溃疡性结肠炎相关。
药物性肝损伤
药物性肝损伤是胆汁淤积性肝病的常见原因。服用各类处方或非处方药、生物制剂、传统中药、保健品（HP）、膳食补充剂及其代谢产物有可能发生药物性肝损伤。
浸润性疾病
在胆汁淤积性肝病的鉴别诊断中应考虑浸润性疾病如淀粉样变性、结节病或淋巴瘤等。提示浸润过程的一个线索是碱性磷酸酶的水平显著升高，血清胆红素浓度中度升高。
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